Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf6Q62311 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms