Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan7Q62283 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan7Q62283 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms