Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SypQ62277 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SypQ62277 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SypQ62277 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SypQ62277 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SypQ62277 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SypQ62277 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms