Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ttf1Q62187 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ttf1Q62187 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ttf1Q62187 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttf1Q62187 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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