Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms