Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema3bQ62177 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema3bQ62177 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms