Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sin3bQ62141 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms