Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2aQ62066 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms