Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna15Q61718 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms