Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msi1Q61474 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms