Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne1Q61457 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms