Protein–RNA interactions for Protein: Q61115

Ptch1, Protein patched homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch1Q61115 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptch1Q61115 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptch1Q61115 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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