Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd6Q61003 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd6Q61003 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms