Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxg1Q60987 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms