Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms