Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Laptm4aQ60961 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms