Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DbpQ60925 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms