Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf8Q60846 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms