Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf4Q60793 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms