Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms