Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atf3Q60765 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms