Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epha1Q60750 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms