Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Samhd1Q60710 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms