Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sik1Q60670 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms