Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema5bQ60519 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms