Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc11Q5U458 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnajc11Q5U458 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms