Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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