Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc42Q5SV66 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms