Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms