Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms