Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc88aQ5SNZ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms