Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlha9Q5RJB0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms