Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav6-2Q5R1I4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav6-2Q5R1I4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms