Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rapgef6Q5NCJ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms