Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim58Q5NCC9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim58Q5NCC9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms