Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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