Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1810065E05RikQ5NC41 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms