Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm2Q5FW85 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm2Q5FW85 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms