Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkaa1Q5EG47 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms