Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc8bQ5DU41 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc8bQ5DU41 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms