Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp13Q5BKP2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp13Q5BKP2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms