Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpjQ569L8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpjQ569L8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms