Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc84Q4VA36 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms