Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr11Q3V1L6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms