Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk4Q3V129 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk4Q3V129 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms