Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b4Q3V0X2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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