Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms