Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garnl3Q3V0G7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms