Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Usp48Q3V0C5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Usp48Q3V0C5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp48Q3V0C5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Usp48Q3V0C5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Usp48Q3V0C5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Usp48Q3V0C5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp48Q3V0C5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp48Q3V0C5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp48Q3V0C5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp48Q3V0C5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp48Q3V0C5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp48Q3V0C5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms