Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms